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普通外科

DNA甲基化特征的鑒定及其在克羅恩病中的臨床價值

作者:佚名 來源:MedSci梅斯 日期:2019-12-11
導讀

         背景及目的: DNA甲基化是調節基因表達的表觀遺傳機制,代表了基因型,環境和疾病之間的重要聯系。這是一種可逆和可遺傳的機制,也許可以為治療某種疾病提供目標。本項研究旨在評估以前與克羅恩病(CD)相關的特定基因的甲基化變化,并研究它們與病理的可能關聯。 方法: 本項研究納入了103名參與者,將他們分為2個隊列(第一個模型隊列[n = 31]和第二個驗證隊列[n = 72]),其中包括了活躍CD(a

關鍵字:  克羅恩病 

        背景及目的:

        DNA甲基化是調節基因表達的表觀遺傳機制,代表了基因型,環境和疾病之間的重要聯系。這是一種可逆和可遺傳的機制,也許可以為治療某種疾病提供目標。本項研究旨在評估以前與克羅恩病(CD)相關的特定基因的甲基化變化,并研究它們與病理的可能關聯。

        方法:

        本項研究納入了103名參與者,將他們分為2個隊列(第一個模型隊列[n = 31]和第二個驗證隊列[n = 72]),其中包括了活躍CD(aCD)和非活躍CD(iCD)以及健康參與者(CTR) 。從所有受試者中的外周血中獲得DNA,并通過Agena平臺進行分析。選擇的基因為過氧化氫酶(CAT),α-防御素5(DEFA5),FasR,FasL,腫瘤壞死因子(TNF),TNFRSF1A,TNFRSF1B,PPA2,ABCB1,NOD2,PPARγ。

        結果:

        研究發現16種CpG在aCD,iCD和CTR中顯示出不同的甲基化特征。研究人員選擇了差異最大的那些進行驗證:DEFA5 CpG_11; CpG_13; CAT CpG_31.32; TNF CpG_4,CpG_12;和ABCB1 CpG_21。結果驗證為DEFA5(甲基化增加)和TNF(甲基化損失)的基因,P值<0.001。在這兩種情況下,甲基化水平均保持不變,且不會隨CD活性而變化(aCD與iCD)。

        討論:

        DEFA5和TNF基因的甲基化狀態提供了標志性生物標志物,可鑒別CD患者并支持CD發病機制中環境和免疫系統的可能作用。

        原始出處:

        Moret-Tatay. Et al.Identification of Epigenetic Methylation Signatures With Clinical Value in Crohn's Disease.Clinical Translational Gastroenterology.2019.

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